استاد فیاضی در تاریخ یک مهر ۶۹ در اولین جلسه تدریس کتاب بدایةالحکمه گفتند:
بعد از اتمام تدریس بدایه، شهید قدوسی از علامه خواستند که کتابی در سطح بالاتری از فلسفه نوشته شود. علامه این بار با در نظر گرفتن مطالب اسفار و تعلیقاتی که ایشان بر اسفار داشت، نهایه را نوشتند. این کتاب در واقع تنقیح مطالب اسفار و حاوی حواشی خود ایشان است. اگر کسی به اسفار مراجعه کند و بعد آن را با نهایه تطبیق کند متوجه می شود که نهایه چه کتاب منقح و درخور تحسینی است.
استاد عبدالرسول عبودیت هم گفتند: فیلم
بدایه و نهایه کتاب درسی نیستند و برای شروع هم اصلا مناسب نیست. ترتیبی هم که خوانده میشود اشتباه است قبل از نهایه، کتاب آموزش فلسفه مصباح یزدی را خواندن اشتباه است زیرا نقدهای بسیاری بر نهایه دارد و درستش این است که بعد از نهایه خوانده شود نه قبل از آن. از خود مرحوم علامه طباطبایی هم نقل شده که من نهایه را برای بعد از اسفار نوشتهام. و جمع بندی نظرات بعد از مشا و اشراق و صدرا است.